Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP58Q9BVL2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms