Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EBF4Q9BQW3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms