Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGD4Q96M96 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms