Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms