Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms