Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms