Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFKFB4Q16877 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PFKFB4Q16877 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms