Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
USF2Q15853 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms