Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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