Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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