Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK13Q14004 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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