Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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