Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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