Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXD4Q12950 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FOXD4Q12950 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms