Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXF2Q12947 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXF2Q12947 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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