Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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