Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPR89BP0CG08 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms