Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms