Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BMM5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BMM5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BMM5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms