Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB9BQ9NP90 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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