Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BBS2Q9BXC9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms