Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNC2Q96PR1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNC2Q96PR1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms