Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXB13Q92826 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms