Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms