Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A3Q16572 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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