Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms