Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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