Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMCO1Q147U7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMCO1Q147U7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMCO1Q147U7 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SMCO1Q147U7 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SMCO1Q147U7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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