Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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