Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DNASE1L3Q13609 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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