Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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