Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
STX4Q12846 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
STX4Q12846 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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STX4Q12846 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
STX4Q12846 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
STX4Q12846 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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