Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms