Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK18Q07002 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK18Q07002 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms