Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LMO4P61968 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms