Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CXCL5P42830 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CXCL5P42830 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CXCL5P42830 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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CXCL5P42830 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CXCL5P42830 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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