Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GGCXP38435 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GGCXP38435 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms