Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FGFR3P22607 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms