Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BGNP21810 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BGNP21810 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BGNP21810 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BGNP21810 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms