Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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