Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRICKLE3O43900 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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