Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLCO3A1Q9UIG8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLCO3A1Q9UIG8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLCO3A1Q9UIG8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLCO3A1Q9UIG8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms