Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHACTR1Q9C0D0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHACTR1Q9C0D0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms