Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM15Q9C019 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms