Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PMCHL2Q9BQD1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms