Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ECSITQ9BQ95 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms