Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms