Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUSD1Q6UWL2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms