Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP135Q66GS9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP135Q66GS9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms