Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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